Le règlement de santé animale (2016/429), complété de son droit dérivé, unifie l'ensemble des textes relatif à la lutte contre les maladies animales transmissibles, y compris les règles induites par les nécessités de la prévention ou de la lutte comme l'identification et la traçabilité des mouvements.

Cependant, il ne traite pas de la prévention propre à certaines maladies zoonotiques qui entre non pas dans le domaine de la santé animale mais dans celui de la santé publique.

De même, il n'aborde que de façon complémentaire aux dispositions générales du règlement 1069/2009, le traitement des sous-produits animaux.